熒光分子標(biāo)記生物大分子最主要優(yōu)點(diǎn)是能夠進(jìn)行實時檢測。熒光標(biāo)記蛋白(抗體)被廣泛用于生物活體示蹤,免疫熒光等領(lǐng)域。由于傳統(tǒng)熒光(FITC,HAM 等)標(biāo)記的靈敏度低,熒光標(biāo)記蛋白用于電泳與電泳相關(guān)技術(shù)的很少。隨著技術(shù)的進(jìn)步,近紅外熒光標(biāo)記大分子被發(fā)現(xiàn)能夠大大提高檢測靈敏度,使之達(dá)到與放射性同位素或化學(xué)發(fā)光(ECL)技術(shù)相當(dāng)?shù)撵`敏度水平。熒光標(biāo)記抗體逐漸被用于Western Blotting 領(lǐng)域,但與ECL Western Blotting 技術(shù)相比,并不能節(jié)省時間與操作步驟,仍需一天的時間出結(jié)果,省掉的只是最后沖印膠片或ECL成像的。比較而言,近紅外熒光EMSA的優(yōu)點(diǎn)非常突出當(dāng)使用近紅外分子標(biāo)記的EMSA探針,EMSA變得非常簡單,快速。
傳統(tǒng)用放射性同位素標(biāo)記探針的EMSA需要5到6天出結(jié)果,天天都要與射線打交道。基于地高辛標(biāo)記的非放射性EMSA需要3天左右出結(jié)果。微奧基因的生物素標(biāo)記探針的EMSA測定(濕轉(zhuǎn)膜,聯(lián)系我們索取資料)可在8小時左右出結(jié)果。以后再經(jīng)過我們科學(xué)家改進(jìn),生物素標(biāo)記探針的EMSA(半干轉(zhuǎn)膜,聯(lián)系我們索取資料)可在4個時左右完成。近紅外EMSA測定技術(shù)可使EMSA測定在2小時左右完成,不僅快,關(guān)鍵是操作非常簡單(查看比較幾種不同EMSA方法),使之成為遠(yuǎn)比Western Blot測定磷酸化信號分子或免疫熒光更為簡便有效的測定轉(zhuǎn)錄因子活性的技術(shù)。近紅外熒光EMSA的優(yōu)點(diǎn)包括:
1) 非放射性。
2) 操作十分簡單,整個操作只相當(dāng)于跑一次垂直板凝膠電泳。
3) 不需要暗室。
4)不需要膠片沖洗設(shè)備與化學(xué)品耗材。
5)出結(jié)果快(2小時左右)。
6) 適合定量分析。
進(jìn)行近紅外熒光EMSA需要以下試劑與設(shè)備:
A. 需要近紅外熒光掃描儀。采用熒光標(biāo)記探針的非放射性EMSA一直有人試,但無法解決靈敏度低的問題。Li cor公司開發(fā)的近紅外熒光技術(shù)與相應(yīng)儀器輝快了長期困擾的靈敏度問題。做近紅外熒光EMSA需要使用Li Cor公司的近紅外掃描儀(Odyssey)。國內(nèi)很多大學(xué)與科研院所都已經(jīng)有了Li Cor 的紅外熒光掃描。我們建議有打算做EMSA測定的客戶去問一問所在單位有沒有共享的Li Cor 掃描儀,畢竟進(jìn)行紅外熒光EMSA方便快速很多。
B)需要近紅外熒光探針。在已經(jīng)有Odyssey近紅外掃描儀的單位進(jìn)行近紅熒光標(biāo)記的EMSA還是有相當(dāng)困難。一是在國內(nèi)沒有任何一家應(yīng)用LiCor公司的lRDye700/800進(jìn)行核酸探針的公司。即使使用替代近紅外熒光(如CY5.5等)來標(biāo)記探針,國內(nèi)外的價格較生物素標(biāo)記貴近4-5倍。例如,5 OD的探針,DNA合成公司對生物素標(biāo)記的收費(fèi)為300-500元/鏈,地高辛標(biāo)記400-600元/鏈。而用CY5.5標(biāo)記DNA鏈的價格為1500-2000元/鏈(生工網(wǎng)上顯示收費(fèi)1500元,寶生物為2200元)。因為EMSA探針為雙鏈,實際合成探針的費(fèi)用還要X2,再加上合成Olig的費(fèi)用。僅僅合成帶近紅熒光寡核苷酸的費(fèi)用就在4000元左右,還不包括后面雙鏈制作,純化以及比活性測定。這樣的費(fèi)用使一些用戶望而卻步,寧可采用相對較便宜的生物素(化學(xué)發(fā)光)標(biāo)記探針的EM
微奧基因公司已經(jīng)有數(shù)十種近紅外熒光標(biāo)記的EMSA探針以優(yōu)惠價格(查看熒光探針目錄)出售,并可以為客戶定制個性化近紅外熒光EMSA 探針。
C)電泳設(shè)備。近紅外熒光EMSA 需要垂直板蛋白電泳裝置。對電泳裝置沒有特別要求。如果電泳裝置曾經(jīng)被用于Western Blotting,必須清洗,侵泡幾天。EMSA測定的所有液體,試劑與裝置都不能有SDS。
D)近紅外熒光探針與樣品反應(yīng)結(jié)合液(微奧基因的成套試劑已包括)。
E)樣品上樣液(微奧基因的成套試劑已包括)。