為什么要做EMSA實驗，EMSA有什么用。

• EMSA（Electronic Mobility Shift Assay) 是測定核酸(RNA/RNA）結合蛋白與目標分子結合活性的一種傳統技術。EMSA應用最多的是測定與雙鏈DNA特定序列結合的結合（查看EMSA工作原理）。 

• 細胞轉錄因子參與基因的調節與控制，與生物體的生老病死都有關系。正常細胞有正常的轉錄因子活性，疾病時就出現異常。差不多每種癌癥細胞都有異常的轉錄因子結合。例如兒童淋巴性白血病大部分都有異常活化的NFkB。頭頸部腫瘤異常活化的STAT3很常見。

• 近年火熱的干細胞與誘導性干細胞技術都涉及到轉錄因子的作用：誘導體細胞向干細胞轉化的幾種基因與基因產物全部都是轉錄因子。

• EMSA結合了電泳技術，能夠對發生結合的轉錄因子進行確認。相對而言，其它任何沒有結合電泳分離技術的測定方法，如基因（核酸）芯片，蛋白芯片，微孔板法轉錄因子結合測定，ChiP篩選測出的活化轉錄因子，都需要用EMSA進行確認。如右圖所示，EMSA測定中出現了6-7條帶。在EMSA測定中，第1與第3電泳道是STAT5陰性，但在生物芯片點陣或微孔板測定中，都會出現陽性信號。

• EMSA是確認核酸結合蛋白活性的金指標，在可預見的相當時間內，EMSA都是對TF活性進行確認的不可替代的技術。

• 結合抗體的Super Shift EMSA是對多聚合體的成分進行鑒定。EMSA結合報告基因的測定能夠確認所涉及到的基因調節控制。</5>

• EMSA測定的轉錄因子活性是細胞信號傳導通路的重要環節，任何信號傳導都會與轉錄因子激活連接并且啟動轉錄過程。信號通路中的分子磷酸化有時并沒有EMSA可檢測的核內轉錄因子，后來用免疫熒光證明核內根本沒有NFkB的核轉運。

• 隨著測定技術的改進，非放射性EMSA能夠比放射性同位素標記的方法（要4-5天出結果）更快出結果，而且比大多數信號傳導通路分子的分析方式更快出結果。利用微奧基因的產品與技術（查看相關技術與產品），EMSA測定最快可以在2-2.5小時完成（查看），靈敏度也超過用放射性同位素標記的方法。